晚上十一点，真新镇的小智正在房间里看着电视里重播无数遍的神奇宝贝对战。
明天就是他到大木博士那里领取初始神奇宝贝并正试成为一名神奇宝贝训练家的日子了，这让他兴奋的目不交睫，于是便看起当成的联盟赛事录播。
看着电视中的神奇宝贝对战，小智大声的说出了自己的目标。
“以成为神奇宝贝训练家为目标做修行之旅，没错，我要向全世界的神奇宝贝宣言，最厉害的神奇宝贝训练师，不，是神奇宝贝大师，那个人，就是我！”
在小智说完自己的目标之后，小智的妈妈花子，拿着一个比比鸟闹钟走了进来
“你到底想撑到什么时候啊小智，现在是晚上十一点，是睡觉的时间喔。”
小智被这一嗓子惊的摔躺到了自己的卡比兽汗玩偶上。
看着妈妈那生气中又有些无奈的表情，小智不好意思的解释到：“可是我明天就要出发了耶，人家睡不着。”
“不行，你一定睡，合理的休息，也是成为神奇宝贝训练师的一部分。”
说着，花子便拿起遥控器，将电视中正在播放的神奇宝贝对战换成了大木博士的初始神奇宝贝讲座，并对小智嘱咐到：“这个看完就快点去睡。”
这是她对小智的神奇宝贝训练家之旅能做的为数不多的帮助。
小智转身，炯炯有神的看着大木博士的讲座，并回到：“好，我知道了啦。”
“记得要换睡衣，不要直接穿着这身衣服睡觉。”
看着如此热血的小智，花子面带宠溺的走出了他的房间。
“在本回真新镇神奇宝贝教育讲座入门篇呢，我最先要推荐的神奇宝贝有妙蛙种子，小火龙，杰尼龟中的任何一只，不论选择哪一只，请看清它们的优点与缺点……”
看完讲座很久之后，睡相如魔墙人偶一般的小智说起了梦话。
“妙蛙种子，培育方法很简单……”
说着这句话，梦境中的小智丢出了精灵球。
“就决定是你了，妙蛙种子……”
“等等，等等，杰尼龟也不错。”
说着话，小智翻身抓起起了自己床头柜上的霹雳电球模型，将其当成了精灵球丢了出去，成功的粉碎了那挂在墙上的闹钟。
第二天早晨，站在房顶的嘟嘟利打起了鸣。
还在说着，“就决定是你了，小火龙！”的小智，听到嘟嘟利的打鸣后，从梦中惊醒了过来。
看着窗外那正当空的大阳，小智连睡衣都没换，直接施展起高速移动，向大木博士的研究所跑去。
在挤过围在研究所附近的一众围观群众及拉拉队后，小智本想继续奔袭冲进研究所，却不小心把小茂给撞倒了。
小茂站起身，嘲笑了一番小智后，开着敞篷车与一众花钱请来的群演以及女朋友告别后，大笑着开始了自己的旅途。
看着如此猖狂的小茂，小智十分生气。
“有什么了不起！”
听到外面动静，走出来查看情况的大木博士，正巧看到了在那生气的小智。
“诶，这不是小智吗？”
小智听到声音后，用瞬间移动跳到大木博士身前。
“大木博士，我的神奇宝贝呢？”
“你的神奇宝贝？”
“嗯，我的神奇宝贝。”
“说的也是啊，他们告诉说，今天预定成为神奇宝贝训练家的是四个人，但小弟弟，你这样不会是打算穿着睡衣去修行吧。”
“修行跟穿的衣服又没有关系，而且我不是小弟弟，根据关都法律，我今年以经是成年人了，总之不管怎么样，给神奇宝贝啦！”
看着使出恐惧颜的小智，大木博士带其走进了研究所。
看着摆在自己面前的小个精灵球。
“我想了好久终于做好了决定，杰尼龟，就决定是你了，我的神奇宝贝。”
说着便拿起了精灵球，将其召唤出来，但却发现这是个空球。
“啊！？”
“杰尼龟，以经被没有迟到的人给拿走了。”
“算我不对，我不该迟到嘛。”
小智放了这个空球，拿起另一个。
“那这样好了，我要妙蛙种子，你就是我的神奇宝贝了。”
结果打开后一看，小智发现自己被梅开二度了。
“这只也被准时过来的人给拿走了。”
“啊？算了，算了，那我就选这个好了，小火龙，你就是我亲自挑选的神奇宝贝喽。”
打开一看后，小智发现是三阳开泰。
“怎么会？”
“搭车就跟选神奇宝贝一样，迟到一秒就可以改变人生的。”
“那…我要俩手空空的出去旅行啊？”
听到这话，大木博士面色有烦恼。
“是还有一只啦，可是……”
小智听到这话大喜过望，直接打断了大木博士的发言。
“给我那只就好啦，不用什么可是。”
听到这话，大木博士拿出那枚精灵球。
“这个被挑剩下的神奇宝贝是有一点问题的喔。”
“反正我会迟到也是因为我有问题嘛。”
“就给你了。”
小智打枚这颗精灵，刹时间电光大作，闪的两人眼镜都难睁大。
“皮卡丘～”
“这只神奇宝贝叫做皮卡丘。”
“好可爱啊，这只明明就很棒嘛。”
说着便伸手，欲将皮卡丘抱入怀中。
“喔？真的是这样吗？”
“当然是这样啦，皮卡丘你好。”
在小智说完这句话并将皮卡丘抱入怀中后。
皮卡丘疑惑的叫了一声，并直接使出了放电。
“怎么会这样？！”
“皮卡丘又名电气鼠，害羞内向，同时又不亲近人类，未经允许触碰它就会这个样子。”
“你怎么不早说？”
大木博士对此不多进行解释。
“那么要赶时间是吗？毕竟你现在开将要踏上旅途，这是饯别礼，神奇宝贝图鉴跟精灵球。”
“谢谢你。”
说着小智便伸手拿起初始装备，并成功的让大木博士也体会到了雷电淬体。
小智抱着皮卡丘走出研究所，看着在门口等候着自己各位街坊邻居与自己的母亲，小智有些抱歉。
“妈妈对不起，我……”
“第一天就迟到是你不对，不过既然要分离了，妈还是帮你准备好了旅行用具，真是的，孩子到最后一刻都还那么让人操心。”
“皮卡丘？”
“你看，衣服、裤子、食物，防灾用的口粮，都是速食的哦，防烫伤用的橡皮手套，攀岩用的安全绳及睡袋，都给你准备好了。”
“这也太夸张了，有神奇宝贝中心，修行也用不到这么多东西啊。”
“说的也是，嗯，这孩子是？”
小智转看皮卡丘介绍到：“它是皮卡丘，是我的神奇宝贝，对不对，皮卡丘？”
哪曾想皮卡丘直接拽过头去，一点不给小智面子。
“诶，好吧。”
“小智，一般神奇宝贝就装在精灵球里的，为什么这孩子它没有？”
“啊，说的也是哦，对了，皮卡丘，进来这里面吧。”
皮卡丘使用叩打将精灵球打了回去，却被小智单手接住。
小智再次丢球，再次失败，重复多次之后，小智明白了皮卡丘不喜欢待在精灵球里面，于是便用登山绳它系在自己的身上，开始旅行。
………………………………
在来到一处上坡的时候，皮卡丘因被拖拽而发出抗议。
“皮卡！皮卡！”
小智只好停下脚片，与其进行沟通。
“皮卡丘，如果你不想一直这样的话，就请跟我一去行走，或让我抱着你行走，可以吗？”
“皮！”
“皮卡丘，你是不是很讨厌我？”
“皮卡，皮卡。”
“可以我很喜欢你诶，我们好待算是起旅行的伙伴，听一下我说的话总可以吧。”
皮卡丘张嘴指了指自己的牙。
“有牙齿，不是不讲话，而是不想讲？好吧，可是你是有训练家的神奇宝贝，应该进精灵球里面才队啊，这个图鉴上也有写啊，你看。”
“哗，被人类所饲养的神奇宝贝，一般会待在精灵球里。”
“你看吧。”
听到这话，皮卡丘跳起来又点了一下图鉴。
“哗，但很多事都有例外，有的神奇宝贝就特别讨厌待在精灵球里面。”
“我知道了，那我们就来和平相处吧，我帮你解掉绳子。”
“好了，绳子解掉了，来个握个手吧，这也行吗？”
这时旁边传来一声响，两者转头一看发现是一只波波。
“哔，波波，鸟神奇宝贝，是飞行的神奇宝贝中个性最温和，最容易捕捉的，是初学者小试身手的最好目标。”
“见了没有？皮卡丘，你就去吧，去抓住它。”
“丘。”
“皮卡丘，你不肯合作吗？”
“皮。”
“这么坚持啊。”
看着以经跑到树上去休息的皮卡丘，小智明白了。
“原来是这样子，好，既然你不肯帮忙，那我就自己去收服它。”
小智将帽子转了一百八十度后，将精灵球向那只波波扔去。
正在进食的波波突然觉得头皮发凉，转头一看，什么都没看清，便被击昏了过去。
看着左右摇晃的精灵球，小智心中有些忐忑。
在摇晃三下后，看着成功收服的波波，小智兴奋无比。
“我成功收神奇宝贝了！”
就在小智正高兴的时候，皮卡丘发出了笑声。
小智回头一看，发现自己的三明治被一只小拉达给偷走了，难怪皮卡丘会笑。
“站住，不要跑，站住。”
在被追逐了一会，小拉达成功逃脱。
看着在逐渐消失在视野中的小拉达，小智非常伤心。
“我的午餐。”
看到这一幕的皮卡丘笑的更开心了，而听到笑声的小智则恼怒的踢飞了路边的一块石头。
这一石头精准的命中一只烈雀后，成功的让小智进入了被追击战。
小智边跑边道歉，却不放出刚收服的宝可梦进行对战，毕竟自己有错在先。
这只烈雀在攻击小智的时候，看到了皮卡丘，于是便直接改变了攻击目标。
看到这一幕，小智又气又迷。
“用石子攻击到你的是我，你为什么要去攻击皮卡丘！”
“哔，野生神奇宝贝多半对人工饲料的神奇宝贝有敌意。”
“啊。”
在皮卡丘躲过烈雀的第三次啄攻击后，皮卡丘做出了回击，一记控制过威力的十万伏特直接将其击落。
这一下惹祸了，这只烈雀直接将它的族群叫了过来。
看到这近百只的烈雀，小智与皮卡丘暂时达成共识，一同开始逃跑。
奈何皮卡丘逃的慢，受到了来自烈雀的巨大伤害。
小智见此，直接将皮卡丘抱入怀中，由自己一人来承担伤害。
因慌不择路，小智最后跑到了一处瀑布边上，转头看到那群烈雀还在追杀自己，小智只能带着皮卡丘一同跳入水中。
在水中游了一段时间后，小智成功的被一位在河边钓鱼的女训练家给救了上来。
看着伤的如此重的小智与皮卡丘，这位女训练家将常磐市的地址告诉了他，并让其赶快到那的神奇宝贝中心去治疗。
小智并想着起身鞠躬道谢，但看到那群烈雀居然顺着水流追过来后，小智直接骑上旁边的脚踏车，向常磐市驶去。
“等一下，那是我的脚踏车诶。”
“借我用一下，我会还你的。”
在小智行驶到一片草地时，突然下起了雨，而群烈雀却还穷追不舍。
小智不停的向常磐市驶，但奈何野外地势坎坷加上雨天路滑，小智一不小心就翻车了。
而他这一翻就给了烈雀们机会了。
因为第一目标是皮卡丘，这些烈雀全都冲向了在小智背后的皮卡丘。
小智为保护皮卡丘不受伤害，直接就挡在了皮卡丘身前。
而看到这愿意舍身保护自己的训练家，皮卡丘强撑着站起身，使出了它现在所能使用的最大威力的打雷，将这群烈雀成功的给吓走了，也成功的将脚踏车给电报废了。
而皮卡丘也因疲劳过度昏倒了。
看着昏倒的皮卡丘，小智一把抱起皮卡丘，向常磐市跑去。
而在小智奔跑的过程中，阳光与彩虹随着一只图鉴中没有记录的神奇宝贝将风雨给替换起了。