由于在第一次会战中吃了苦头，乌尔班不得不开始重视起蚂蚁一族的战斗力。经过短暂的休整，这位神皇再度掀起了战争。除了命令蝗虫主力部队全力进攻敌军，他一方面逼迫祭司集团加快战争科技工程的建设以应对四面开花的普通蚂蚁及附属族的起义，另一方面又召来大量沙漠五民中的优秀异能者去和敌军异能者较量，忙的跳跃足打触角，全力镇压对方。
见敌人如此重视自己，革新阵线一方的民众们自然也没有坐以待毙，文士出谋划策，武将悍不畏死，蚁后和雄蚁们一面玩命生娃一面发表种种振奋人心的演讲，广大工蚁兵蚁民众众志成城，为革新阵线的每一场战斗和内部建设贡献自己的力量。最高领导层的成员更是为了革命大业忙得不可开交，戈尔丁和罗斯殚精竭虑，工作到几乎日夜不眠，将革新阵线的内政治理的井井有条；阿莱西娅和哈里则相互合作，各尽其长共抗外侮，前者灵活的将大军转移于战场的各处，后者凭高强的战斗力多次带兵击破蝗虫的主力部队，为革新阵线带来一场又一场的胜利。
在阿波罗四年9月12日到9月28日的这段时间内，旧蚂蚁帝国的领土至上两方势力的大军在机关武器和异能者战士的辅助下，围绕着首都之外的十个天机大阵点进行了高烈度的战争，还伴随着大规模的治安战、阵地战、间谍战。在这一过程中，双方的死伤者成万上亿。渐渐的，双方的部下都打不动了，出现了厌战情绪。由于革新阵线一方身背驱除蝗虫的反侵略反压迫责任，他们尚且还能维持些许战意。但祭司集团和其背后的蝗虫、蚁蜂势力的成员们则难以维持对战争的热情，逐渐陷入了消极避战中，在没有取得多少军事胜利的情况下，仅靠天机屏蔽和“极乐世界”的谎言驱动教廷军队继续赴死无异于痴人说梦，而选择来打仗的蝗虫和蚁蜂也是冲着好日子而不是送死来的。针对这一问题，一位擅长布置交易性阵法的祭司声称他能简化战争流程，出了个馊主意：由自己先后在十个阵点处布下由异能规则约束的1对1决斗场，双方各派出十位战士在十个决斗场分别进行决斗，杀死或赶走对方者胜利。本着该异能公平交易的原则，如果革新阵线一方胜利，那么该阵点解体，反之，这一阵点会强化并永久留存，并吞噬环阵点一百米处的敌军。
这个计策引起了很大的非议，但乌尔班和几位高层祭司对己方的异能者非常有自信，同意施行这一计划，并将其通知了自己的敌人。得知这一消息，革新阵线内部炸开了锅，怀疑对方有诈和怀疑自身异能者实力不济的声音此起彼伏。四位领导者先是稳住了革新阵线内部的局势，随后对敌方施行的异能招数进行了研究，发现没有别的什么好办法能够迅速解决阵点争夺问题。最终他们力排众议答应了，开始挑选参与决斗的战士。
阿波罗四年9月30日，蚁蝗第二次会战迎来了尾声——十对十阵点争夺战。对于革新阵线或是祭司集团的参战者而言，成败在此一举，因此他们基本都做好了赴死的准备。但沙漠五民一系的的参战者对此倒没什么拼死决战的觉悟，只是因为此战利益太大和乌尔班的强烈要求（甚至说得上强行逼迫）才来参战。
第一阵点处，火蚁霍姆斯对上了祭司集团十圣之一的“幽魂斗士”瓦夏，后者一见到她便趾高气昂地叫嚣道：“不敬神的小贼，还妄想挑战祭司，简直是太愚蠢了。我保证，在我的火焰之下，你会去向地狱，永远到不了极乐世界。”
“卖族求荣拜伪神的叛徒，怎么敢言极乐世界？老东西，如果有谁要下地狱，那一定是你！”霍姆斯不怒反笑嘲讽道。
“幽火，起！”瓦夏知自己辩不过对方，索性直接施展异能想要杀了对方。她的触角散发出蓝光，并疯狂地抖动起来，与附近旷野中的无数尸体发生共鸣。顷刻之间，这些尸体上燃起了青白色的火焰。随后在瓦夏的牵引下，四方的鬼火飘向空中，在这位祭司头顶三米处汇聚成一个球体，球体边缘的火苗则似游蛇一样灵敏的窜动着，显露出诡异的情状。
“去吧，极乐世界的圣魂之火，把那个污浊之物净化吧！”瓦夏露出残忍的笑容，操纵鬼火向霍姆斯袭去。
“玩火算什么本事，我也会！万烛归心彩真炎，去！”见敌方来势汹汹，霍姆斯自然不敢怠慢，用出了自己最强的一招。
发动这一威力巨大的火焰异能并不容易，需要释放信号与其他至少一万只火蚁共鸣，在获得他们的精神支持后方可点燃这种奇妙的火焰。由于此前霍姆斯在第一次会战中的英勇表现得到了广大火蚁群众的认可，她顺利点燃并喷出了绚丽多彩的流焰。霍姆斯的彩焰和瓦夏的鬼火自碰撞之时就疯狂地相互侵蚀，进行着激烈的交锋。经过三分钟的火焰对碰，瓦夏逐步落了下风，毕竟，尸体之数有限，信仰之力却是无限的，长期打下去对她不利。“幽魂斗士”心一横，在短暂时间内加速了鬼火的制造和侵袭，试图毕其功于一役。但霍姆斯已经看清了对方的实力，稳扎稳打防住了对方的进攻。又过了十分钟，瓦夏的鬼火彻底耗尽了，堂堂“十圣”，连遗言都未留下就变成了焦炭。
第二阵点的战斗比较乏味，蚜虫一族最强的异能者蜜泽主动请缨出战，对上了祭司“十圣”中拥有制造并操纵丝线（甚至可以改变其硬度）的异能的“轻丝老佛”千纤。千纤释放出大量的丝线，试图捕捉并绞杀前者未果，反倒被蜜泽运用异能制造的凝胶给囚禁住了，无法挣脱开来，窒息于凝胶风干形成的“琥珀”中。
第三阵点的战斗爆发于螽斯首领铁皮蝈蝈青甲和“定洲之民”中的豪杰棉蝗卡兰诺，两者所拥有的异能都相当朴素：强化叫声和外骨骼。因此，两虫的决斗过程自然也相当的简单粗暴：一面同时发出威胁性的叫声，一面运起异能跳向对方。实力不相上下的两虫毫不留情地扭打在一起，疯狂地互踢互扑互咬，出牙招招致命。经半个小时后的塵战，双方都伤痕累累，青甲丢了右边的触角，卡兰诺断了左中足，各趴在一方气喘吁吁。“咱可不想丢了命，我这次打成这样对乌尔班算仁至义尽了。”卡兰诺先露了怯，在青甲再次振作准备进攻后遛之大吉了。
第四阵点的守卫者是蚁蜂一族的异能者锥空，这位的操作是最骚的，都没打算参与战斗，而是直接代表蚁蜂一族同蚂蚁派出的挑战者举腹蚁翘末进行谈判，希望能够带走一部分目前已经为他们所控制的亲祭司派繁殖蚁回到自己过去的领地，为他们将来的繁衍大业而服务。而作为报偿，蚁蜂一族将从蚂蚁的领地上全面撤离部众，并在革新阵线同祭司集团爆发的战争中两不相帮。当然，锥空也做出了暗示，如果蚂蚁一族不同意，他们也会把这些蚁后带回领地，还会帮助蝗虫镇压革新阵线。得知此事的翘末不敢怠慢，立刻通知了在一旁观战的戈尔丁。
考虑到双方虽有一些仇怨，但革新阵线的主要敌人还是蝗虫和祭司，且那些与祭司集团勾结的繁殖蚁如果被掳走不过是获得了与其德性匹配的下场，戈尔丁最终选择了同意。锥空倒也信守诺言，直接让出了阵点，并于七日内撤走了所有的蚁蜂。
负责进攻第五阵点的是善于操纵真菌的切叶蚁蕈风。在到达正阵点的那一刻，她差点没戳破自己的眼睛，自己的敌人居然是一个浮在空中的，通体散发着红光的仙人掌。
“这是怎么一回事？自己面对的敌人难道不是蚂蚁计时和蝗虫吗？那又能是什么东西？要怎么打？”本来已经想好“真菌寄生”战术的蕈风看到红色仙人掌，陷入了凌乱。
当然，疑惑归疑惑，打总归是要继续打的。蕈风迅速召唤来数百个被真菌寄生的虫尸，试图操纵他们爬上仙人掌一探究竟。这时，仙人掌作出了回击，射出无数红色针刺，将虫尸们击毁.或牢牢钉在地上。看来这个仙人掌的背后一定有操纵者！见仙人掌的回击如此迅速，蕈风认定了这一点。
见寄生控尸之术不奏效，切叶蚁最终选择迅速播撒出大量的孢子来帮助自己战斗。孢子们在不到一分钟内就生长成数百种蘑菇，而作为回应，红色仙人掌的操纵者也在短时间内种出了大量的仙人掌，双方展开了一场精彩绝伦的的斗法。红色仙人掌不断发射各种奇形怪状的的红色异能光球和针刺，并操纵着中出的傀儡仙人掌向蕈风袭来。而这位切叶蚁异能者也不甘落后，将自己此前开发出的三种蘑菇异能结合运用，进行了激烈的反击：她除了操纵着傀儡蘑菇和仙人掌碰撞，并释放出傀儡蘑菇内部隐藏的特殊异能光球（效果包括不限于冰冻、电击、灼烧等）回击对手，还释放出自己提炼的菌毒之气（含有真菌毒素的异能气态物），试图将藏在仙人掌内的敌虫毒杀。但是对面的虫子显然发觉了他的打算，也作出了自己的应对之策——
它散出了大片蜡状物，并以异能将其构建成特殊护盾挡住了毒气。蕈风和红色仙人掌的操纵者的这场斗法持续了三个小时，直到双方都累得无法动弹，地面上蘑菇和仙人掌不断碰撞，在空中双方释放的异能光球互相碰撞或四散开来，产生了剧烈爆炸。这时红色仙人掌的操纵者才现出了真容——他是一只红色的介壳虫——也就是常年寄生于仙人掌之上的胭脂虫。
“能把我逼到这个地步，你挺厉害啊，毕竟我是依靠和同胞共鸣才能打这么久的。对了，自我介绍一下吧，我是胭脂虫族的首领，殷朱王。你叫什么名字？”胭脂虫笑道。
“我叫蕈风，切叶蚁族的战士，别妄想和我套近乎。不把你们这些侵略者赶走，我绝不会罢休。”倒在地上的切叶蚁无力地说。
“侵略者吗……也对，毕竟我还是帮了乌尔班的忙。不过，算你走运，这场战斗你赢了，我马上就带着这仙人掌撤。”殷朱王语出惊人，切叶蚁蕈风瞪大了眼睛，一副不可置信的样子。
“很惊讶么？首先，我之前说过，我能共鸣全族的力量，虽然不能将其全运用，但是动用其中的两成还是没问题的，而你以一己之力扛住了我族两成之力，理当是胜者，当然还有一个原因，我也打不动了。除此之外，我只答应过来帮乌尔班的忙，但没有做出一定会胜利的许诺，就个体而言，我也不想参与这场侵略战，因为我觉得你们保卫家园的精神是可敬的。当然，如果你哪天带军打进了沙漠，我也会一样。那时我能在主场用那两成力打千百个你。要知道，任何虫子在保卫自己的家园时都是很厉害的。我走了，蕈风，和你打的蛮愉快的，最好以后永久不见，以为再见的时候没准就又打仗了。”说罢，殷朱王操纵仙人掌飞远，留下切叶蚁沉默于当场。明明胜利了，但蕈风却感到沮丧，究竟是耻于失败还是因为别的什么？他也不知。
第六阵点，巴西角蝉四瘤击退了蚁蛉首领晶翅。作为有共鸣能力的异能者，一开始四瘤试图借用其他角蝉异能者的力量取胜，但他的计划落空了——晶翅拥有看清阿波罗气息并切断其联系的异能（阉割蚂蚁等虫子的灵智也是这个道理），轻易破解了对方的共鸣之术。不得已，四瘤只好释放出自己的本体异能四光球来迎击晶翅。在战斗中，晶翅用三分钟成功切断了四光球和四瘤的联系，但翅膀却在战斗的过程中因受对方的冲撞受了小伤，这让他心疼不己。本着明哲保身的态度（也就是害怕折断翅膀变成废虫），蚁蛉首领最后选择了撤退。
再看七八九三个阵点的争夺战，获胜者皆为革新阵线。革新阵线攻略第七阵点的战斗很顺利，“十圣”之一的“泥甲战士”土岩还未使去控制泥傀的异能就被子弹蚁异能者霍闪用雷电劈死了。第八阵点的的攻略战虽然遇到了一点小挫折，但战果也大差不差：拥有禁锢他者身形异能的蜜蚁定珠用了十几分钟从迷雾中发现了不断游走着的祭司“十圣”之一，试图袭击他的“云雾仙人”隐云，并将对方定身后撕成了碎片。而第九阵点的的战斗简直可以用离谱来形容，负责镇守此地的的飞蝗将领枯沙误把革新阵线派遣的进攻者公牛蚁达卡波当成了曾在战场上杀死自己大量同伴的哈里，心灵受到了不小的震慑。为了保命，枯沙直接丢下阵点跑路了，留下达卡波待在原地一脸懵逼。
负责攻打第十阵点的是哈里，和其他进攻者不同，她并没有在第一时间赶去进攻，而是一直在绕路，并击溃自己在路上所遇到的所有祭司和蝗虫的的队伍，不论他们是否有意阻拦自己。这一举动让祭司和蝗虫们极其费解，最后还是乌尔班的次子侯赛因猜出了对方的想法：哈里传达的意思是：我够强，到我打的时候别随便找只虫糊弄我，最好找个高手，反正我总归能将其击败甚至杀掉。也就是说，她希望借此机会击杀一名蝗虫高手，之后革新阵线的革命活动扫除一些隐患。
明白事情原委后，原本就打算找弱者糊弄的的乌尔班等虫松了口气，哈里她狂任她狂，但只要自己不上当，她也没有办法。反正丢了一处阵点也不是什么大事，若为此承担损失一名高手的风险可太不值了。但很快，蝗虫和祭司们得到了相当炸裂的消息，他们防守的九个阵点皆被敌方攻陷了，“十圣”折损其四，沙漠五民的高手也都败退了，第十阵点变成了仅有的宝贝疙瘩，哈里也开始朝那边行进了。祭司和蝗虫们迫于形式，只得改变计划，派遣侯赛因这位优秀的飞蝗战将与哈里对决。
被赶鸭子上架的侯赛因面色阴沉叹气着向第十阵点飞去。他以前在战阵中观察过哈里，深知自己虽强，但也不是她的对手。这是一场没有意义的必输的战斗，但自己迫于身份必须前往。真不知道究竟哪个蛆养的家伙想出这个鸟屎对决方式的？算了，怪他也没有用，提出这个馊主意的祭司在九个阵点丢失之后就被暴怒的乌尔班扔进极乐世界了。说实话，他自己倒也挺想见识一下哈里的手段的，但如果不全力以赴恐怕就没命了。
“啃瓢虫粪的披蛞蝓鼻涕当神袍的蝗虫，还有跟在他们后面吃二转子屎的教廷杂种渣子呢？一个个都吓破了胆，不敢来会会我吗？”已经到达第十阵点的哈里大声挑衅着。
“哈里，你莫要太嚣张了。这样子的哈里大师倒也丢份儿，我还以为蚂蚁第一大将是什么高手呢，原来是仗着天赋学会了个三招两式二杆子小蚂蚁，我侯赛因来会会你。”听到对方嘲讽之言的侯赛因反唇相讥降，随后挟一些沙尘落在了决斗地点。
“你有命再说一遍吗？侯赛因“神明大人”？”哈里冷笑，挥足便向对方发射出一个巨大的绿色光球，想一下将其炸死。
“也许没有吧，但总归可以试试。”侯赛因引动了自己的第一项异能——沙尘控制，他操纵着流沙和尘暴挡住了绿色光球的爆炸，并策动这些沙子一齐从四面八方攻向哈里。
“控沙，有意思，但还不够看。不过我倒是有和你玩玩的兴趣了，接下来我要动真格的了。”哈里一笑，制造了球形红色光盾挡住了沙暴的袭击。随后，她释放出数百种千奇百怪的远攻手段，操纵其如暴风骤雨般向侯赛因袭去。
“彩光流沙。”侯赛因将异能赋予于自己操纵的流沙之中，沙子瞬间变得五彩斑斓。蝗虫随即操纵这些异能彩沙来防御对方的远攻并进行反击。双方就这样远程对轰了十三分钟，侯赛因累得气喘吁吁，而哈里还一脸轻松的样子。
“你快撑不住了吧，估计再打个几分钟你就完了。不过，就凭侯赛因你刚才说的那些话，就这样轰死你，太便宜你了，尝尝这一招。千兵群起！”哈里停止远程攻击，凭空用异能召唤出了数千的蚂蚁状傀儡士兵，想群起围攻之并将其撕碎。
但侯赛因反倒因此松了一口气，也操纵异能制造出了几百个由沙子制成的傀儡蝗虫，和哈里造出的士兵对攻，并成功的挡住了对方。见这招不奏效。哈里又召唤了出名为“巨蚁”的法相（类似一个为主人而战的一个放大十倍的公牛蚁）向侯赛因袭去，后者毫无招架之力，只得和其他蝗虫异能者共鸣，勉励发动侵蚀之风（可以理解为气流绞肉机）这一异能将法相击碎。法相碎裂之后，哈里对侯赛因也变得有些重视了，收起了逗弄之的兴趣，准备展现出真正的实力。她知道这位蝗虫异能者的实力虽然远不如自己，但对别的蚂蚁而言也足够可怕。“囚之光！”哈里召唤出了一条绿色的光索，并击中和缠住了力竭的侯赛因。
一被光索缠住，侯赛因就大感不妙，不仅是因为自己被囚，更因为他感受到了这不是普通的光索，它会阻遏自己的异能使用，并加速其生命流逝。必须赶快挣脱，蝗虫暗想。几秒钟后，侯赛因就有了机会，由于意外碰到了自己之前释放的含有异能的沙尘，使得光索的异能阻遏效果失灵，他用尽全身力气使出遁术，最后成功隐入沙尘中瞬移离开了。哈里成了胜者。
“我居然失手了，这家伙不容小觑啊。开始就不该被自己的情绪主导，选择和他玩儿的。应该拼尽全力把他的命留在这里。算了，反正我的任务也完成了。”哈里有些失望地扬长而去。
至此，蚁蝗第二次会战以革新阵线的全面胜利而告终。这场战役对于蚂蚁一族的复兴和解放有着重大的战略意义，经此一役，革新阵线进一步削弱了自己的敌人：祭司集团弄巧成拙，损失惨重，其用于愚昧民众的天机大阵也基本失效，除靠近首都王畿和靠近沙漠边境的地区基本都在接下来的日子里为核心阵线所占领；蚁蜂一族选择退出这场战争；除飞蝗之外的沙漠四民领袖拒绝继续为乌尔班卖命牺牲，都以仁至义尽为由将自己在蚂蚁土地上的部众撤回了沙漠之中，主战派飞蝗们陷入了孤军奋战之中。在敌方衰落的背景下，以革新阵线为代表，蚂蚁及其附属族为主力的反蝗虫反祭司运动也至此进入了反攻阶段。
这场战役的失利也引发了飞蝗群体内部的政治路线分歧：以乌尔班长子堪培拉和次子侯赛因代表的很多飞蝗保守派认为取得全面战争胜利已不可能，纷纷表达了应当见好就收保存实力，抛弃所谓圣蚁汗国的首都，带走祭司集团并割占边境土地，并同革新阵线划定新边界的想法。这是非常理性的，且符合一众蝗虫现在的实力。但祭司集团即使经历惨重的损失，也不会愿意放弃首都的经营和自己的权力，乌尔班更是已经魔怔地沉溺于统治蚂蚁的千秋大梦之中，他们合力压制了沙漠五民中理性保守派的声音，选择继续和革新阵线对抗下去，纵万冢枯骨亦不愿回头。很快，这两股势力就将联合对革新阵线发起一次疯狂的反扑，革新阵线诸将和广大蚁族及其附属族群众也将面临一次异常严峻的考验。